Il convento venera il culto di San Francesco d’Assisi, che nella zona si stabilì come punto di passaggio verso la Puglia, ove questi andava in pellegrinaggio nel santuario di San Michele sul Gargano. Il complesso si sviluppa sulle antiche chiesette, duecentesca e quattrocentesca, nella forma della ristrutturazione di metà 1700, che lo compone della chiesa barocca, del campanile quattrocentesco, degli alloggi conventuali.
Gli interventi hanno ornato di pavimenti maiolicati e stucchi pregiati sulle pareti, gli scavi operati in tempi recenti hanno portato alla luce le mura perimetrali della chiesa antica e della necropoli. La chiesa di San Francesco è inoltre custode del “monumento degli innamorati”, il sarcofago che ospita le spoglie di Diego I Cavaniglia, fatto realizzare dalla vedova, alla cui morte ai piedi del sepolcro ella volle essere sepolta (benché poi la lapide sia stata spostata nel transetto), anch’esso oggetto di pellegrinaggio.
